Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gp1bbP56400 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gp1bbP56400 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gp1bbP56400 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gp1bbP56400 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms