Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp1P56183 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rrp1P56183 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp1P56183 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms