Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcd3P55096 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd3P55096 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd3P55096 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms