Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc12a1P55014 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc12a1P55014 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc12a1P55014 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms