Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acod1P54987 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Acod1P54987 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Acod1P54987 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acod1P54987 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms