Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ephb3P54754 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ephb3P54754 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ephb3P54754 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms