Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nub1P54729 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nub1P54729 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nub1P54729 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nub1P54729 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nub1P54729 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nub1P54729 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nub1P54729 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nub1P54729 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nub1P54729 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nub1P54729 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nub1P54729 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nub1P54729 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nub1P54729 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nub1P54729 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nub1P54729 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nub1P54729 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nub1P54729 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nub1P54729 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nub1P54729 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms