Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad23bP54728 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad23bP54728 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad23bP54728 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms