Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolgP54099 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolgP54099 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolgP54099 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolgP54099 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PolgP54099 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PolgP54099 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolgP54099 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolgP54099 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolgP54099 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PolgP54099 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolgP54099 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolgP54099 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolgP54099 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolgP54099 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolgP54099 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolgP54099 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolgP54099 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolgP54099 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolgP54099 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolgP54099 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolgP54099 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolgP54099 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolgP54099 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolgP54099 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolgP54099 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolgP54099 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolgP54099 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolgP54099 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PolgP54099 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PolgP54099 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolgP54099 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolgP54099 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolgP54099 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolgP54099 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolgP54099 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolgP54099 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolgP54099 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolgP54099 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolgP54099 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolgP54099 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolgP54099 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolgP54099 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolgP54099 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolgP54099 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolgP54099 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolgP54099 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolgP54099 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolgP54099 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolgP54099 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolgP54099 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolgP54099 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolgP54099 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolgP54099 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PolgP54099 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolgP54099 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolgP54099 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolgP54099 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolgP54099 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolgP54099 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolgP54099 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolgP54099 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolgP54099 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolgP54099 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolgP54099 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolgP54099 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolgP54099 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolgP54099 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolgP54099 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PolgP54099 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms