Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PctpP53808 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PctpP53808 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PctpP53808 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PctpP53808 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PctpP53808 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PctpP53808 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PctpP53808 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PctpP53808 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PctpP53808 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PctpP53808 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PctpP53808 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PctpP53808 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PctpP53808 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PctpP53808 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PctpP53808 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PctpP53808 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PctpP53808 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PctpP53808 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PctpP53808 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PctpP53808 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PctpP53808 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PctpP53808 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PctpP53808 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PctpP53808 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PctpP53808 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PctpP53808 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PctpP53808 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PctpP53808 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PctpP53808 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PctpP53808 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PctpP53808 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PctpP53808 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PctpP53808 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PctpP53808 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PctpP53808 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PctpP53808 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PctpP53808 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PctpP53808 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PctpP53808 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PctpP53808 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PctpP53808 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PctpP53808 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PctpP53808 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PctpP53808 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PctpP53808 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PctpP53808 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PctpP53808 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PctpP53808 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PctpP53808 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PctpP53808 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PctpP53808 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PctpP53808 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PctpP53808 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PctpP53808 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PctpP53808 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PctpP53808 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PctpP53808 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PctpP53808 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PctpP53808 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PctpP53808 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PctpP53808 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PctpP53808 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PctpP53808 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms