Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fdft1P53798 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Fdft1P53798 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fdft1P53798 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms