Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RabggtbP53612 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RabggtbP53612 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RabggtbP53612 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtbP53612 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtbP53612 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtbP53612 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RabggtbP53612 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtbP53612 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RabggtbP53612 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtbP53612 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RabggtbP53612 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtbP53612 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtbP53612 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtbP53612 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtbP53612 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RabggtbP53612 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtbP53612 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtbP53612 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtbP53612 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtbP53612 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RabggtbP53612 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtbP53612 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtbP53612 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RabggtbP53612 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RabggtbP53612 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtbP53612 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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