Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CebpaP53566 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CebpaP53566 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CebpaP53566 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CebpaP53566 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CebpaP53566 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CebpaP53566 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms