Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Map3k1P53349 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Map3k1P53349 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Map3k1P53349 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Map3k1P53349 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms