Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efnb1P52795 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efnb1P52795 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms