Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e3P52483 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e3P52483 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms