Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e1P52482 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2e1P52482 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms