Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SqleP52019 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SqleP52019 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SqleP52019 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SqleP52019 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SqleP52019 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SqleP52019 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SqleP52019 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SqleP52019 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SqleP52019 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SqleP52019 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SqleP52019 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SqleP52019 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SqleP52019 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SqleP52019 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SqleP52019 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SqleP52019 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SqleP52019 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SqleP52019 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SqleP52019 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SqleP52019 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SqleP52019 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SqleP52019 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SqleP52019 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SqleP52019 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SqleP52019 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SqleP52019 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SqleP52019 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SqleP52019 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SqleP52019 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SqleP52019 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SqleP52019 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SqleP52019 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SqleP52019 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SqleP52019 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SqleP52019 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SqleP52019 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SqleP52019 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SqleP52019 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SqleP52019 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SqleP52019 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SqleP52019 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SqleP52019 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SqleP52019 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SqleP52019 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SqleP52019 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SqleP52019 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SqleP52019 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SqleP52019 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SqleP52019 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SqleP52019 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SqleP52019 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SqleP52019 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SqleP52019 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SqleP52019 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SqleP52019 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SqleP52019 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SqleP52019 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SqleP52019 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SqleP52019 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SqleP52019 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SqleP52019 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SqleP52019 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SqleP52019 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SqleP52019 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SqleP52019 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SqleP52019 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SqleP52019 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SqleP52019 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SqleP52019 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SqleP52019 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SqleP52019 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SqleP52019 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SqleP52019 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SqleP52019 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SqleP52019 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SqleP52019 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SqleP52019 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SqleP52019 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SqleP52019 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms