Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApodP51910 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ApodP51910 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApodP51910 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApodP51910 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApodP51910 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApodP51910 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApodP51910 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApodP51910 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApodP51910 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApodP51910 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApodP51910 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApodP51910 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApodP51910 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApodP51910 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApodP51910 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApodP51910 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApodP51910 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApodP51910 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApodP51910 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApodP51910 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ApodP51910 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApodP51910 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApodP51910 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApodP51910 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApodP51910 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApodP51910 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApodP51910 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApodP51910 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApodP51910 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApodP51910 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ApodP51910 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ApodP51910 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ApodP51910 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ApodP51910 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ApodP51910 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApodP51910 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApodP51910 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ApodP51910 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ApodP51910 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ApodP51910 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ApodP51910 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ApodP51910 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ApodP51910 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ApodP51910 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ApodP51910 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ApodP51910 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms