Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccr4P51680 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms