Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccr1P51675 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccr1P51675 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccr1P51675 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms