Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XpcP51612 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XpcP51612 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XpcP51612 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XpcP51612 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XpcP51612 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XpcP51612 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XpcP51612 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XpcP51612 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XpcP51612 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XpcP51612 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XpcP51612 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XpcP51612 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XpcP51612 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XpcP51612 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XpcP51612 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XpcP51612 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XpcP51612 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XpcP51612 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XpcP51612 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XpcP51612 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XpcP51612 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XpcP51612 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XpcP51612 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XpcP51612 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XpcP51612 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XpcP51612 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
XpcP51612 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XpcP51612 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
XpcP51612 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XpcP51612 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XpcP51612 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XpcP51612 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XpcP51612 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XpcP51612 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XpcP51612 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XpcP51612 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XpcP51612 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XpcP51612 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XpcP51612 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XpcP51612 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XpcP51612 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XpcP51612 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XpcP51612 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XpcP51612 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XpcP51612 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XpcP51612 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XpcP51612 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XpcP51612 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XpcP51612 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XpcP51612 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XpcP51612 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XpcP51612 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XpcP51612 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XpcP51612 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XpcP51612 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XpcP51612 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XpcP51612 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
XpcP51612 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XpcP51612 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XpcP51612 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XpcP51612 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XpcP51612 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XpcP51612 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
XpcP51612 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XpcP51612 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
XpcP51612 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XpcP51612 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
XpcP51612 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XpcP51612 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XpcP51612 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XpcP51612 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XpcP51612 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XpcP51612 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XpcP51612 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XpcP51612 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XpcP51612 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XpcP51612 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XpcP51612 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms