Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FmodP50608 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FmodP50608 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FmodP50608 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FmodP50608 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FmodP50608 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FmodP50608 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FmodP50608 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FmodP50608 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FmodP50608 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FmodP50608 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FmodP50608 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FmodP50608 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FmodP50608 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FmodP50608 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FmodP50608 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FmodP50608 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FmodP50608 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FmodP50608 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FmodP50608 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FmodP50608 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FmodP50608 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FmodP50608 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FmodP50608 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FmodP50608 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FmodP50608 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FmodP50608 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FmodP50608 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FmodP50608 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FmodP50608 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FmodP50608 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FmodP50608 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FmodP50608 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FmodP50608 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FmodP50608 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FmodP50608 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FmodP50608 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FmodP50608 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FmodP50608 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FmodP50608 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FmodP50608 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FmodP50608 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FmodP50608 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FmodP50608 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FmodP50608 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FmodP50608 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FmodP50608 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FmodP50608 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms