Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpbP50405 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SftpbP50405 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpbP50405 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpbP50405 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpbP50405 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SftpbP50405 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SftpbP50405 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms