Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SftpdP50404 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SftpdP50404 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SftpdP50404 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SftpdP50404 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SftpdP50404 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SftpdP50404 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SftpdP50404 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SftpdP50404 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms