Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LtbrP50284 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LtbrP50284 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LtbrP50284 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LtbrP50284 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LtbrP50284 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LtbrP50284 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LtbrP50284 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LtbrP50284 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LtbrP50284 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms