Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd7P50283 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd7P50283 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd7P50283 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd7P50283 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd7P50283 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd7P50283 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd7P50283 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd7P50283 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd7P50283 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd7P50283 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd7P50283 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd7P50283 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd7P50283 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd7P50283 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms