Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VegfbP49766 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfbP49766 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VegfbP49766 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfbP49766 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfbP49766 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms