Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptx3P48759 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptx3P48759 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx3P48759 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms