Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brca1P48754 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brca1P48754 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brca1P48754 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brca1P48754 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brca1P48754 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brca1P48754 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brca1P48754 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca1P48754 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Brca1P48754 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brca1P48754 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brca1P48754 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brca1P48754 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms