Protein–RNA interactions for Protein: P48320

Gad2, Glutamate decarboxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gad2P48320 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad2P48320 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad2P48320 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad2P48320 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad2P48320 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad2P48320 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad2P48320 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad2P48320 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gad2P48320 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gad2P48320 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gad2P48320 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gad2P48320 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad2P48320 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad2P48320 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gad2P48320 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gad2P48320 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gad2P48320 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gad2P48320 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms