Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfaP48030 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfaP48030 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfaP48030 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TgfaP48030 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfaP48030 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfaP48030 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfaP48030 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfaP48030 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfaP48030 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TgfaP48030 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TgfaP48030 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TgfaP48030 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TgfaP48030 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TgfaP48030 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TgfaP48030 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TgfaP48030 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TgfaP48030 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms