Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl13P47963 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms