Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Igfbp6P47880 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Igfbp6P47880 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Igfbp6P47880 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms