Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SrprbP47758 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrprbP47758 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrprbP47758 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrprbP47758 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrprbP47758 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SrprbP47758 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms