Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax7P47239 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax7P47239 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax7P47239 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax7P47239 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax7P47239 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax7P47239 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax7P47239 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax7P47239 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax7P47239 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax7P47239 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms