Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tulp2P46686 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tulp2P46686 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tulp2P46686 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tulp2P46686 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms