Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlx1P43345 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlx1P43345 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlx1P43345 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms