Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec3bP43025 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec3bP43025 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec3bP43025 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec3bP43025 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec3bP43025 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec3bP43025 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clec3bP43025 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clec3bP43025 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clec3bP43025 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec3bP43025 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec3bP43025 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec3bP43025 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms