Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc19a1P41438 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc19a1P41438 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc19a1P41438 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms