Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl28P41105 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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