Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ThpoP40226 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ThpoP40226 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ThpoP40226 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ThpoP40226 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ThpoP40226 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ThpoP40226 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ThpoP40226 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ThpoP40226 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms