Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timp3P39876 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Timp3P39876 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Timp3P39876 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Timp3P39876 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Timp3P39876 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms