Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik2P39087 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik2P39087 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grik2P39087 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik2P39087 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grik2P39087 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik2P39087 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik2P39087 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik2P39087 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik2P39087 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik2P39087 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik2P39087 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms