Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig1P37913 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig1P37913 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lig1P37913 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig1P37913 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig1P37913 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig1P37913 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lig1P37913 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lig1P37913 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lig1P37913 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig1P37913 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig1P37913 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig1P37913 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig1P37913 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig1P37913 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lig1P37913 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms