Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn1P35821 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn1P35821 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn1P35821 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms