Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mmp12P34960 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mmp12P34960 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mmp12P34960 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp12P34960 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp12P34960 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp12P34960 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp12P34960 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp12P34960 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp12P34960 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp12P34960 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp12P34960 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mmp12P34960 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms