Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OatP29758 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OatP29758 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OatP29758 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OatP29758 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OatP29758 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OatP29758 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OatP29758 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OatP29758 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OatP29758 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OatP29758 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OatP29758 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OatP29758 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OatP29758 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OatP29758 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OatP29758 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OatP29758 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OatP29758 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OatP29758 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OatP29758 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OatP29758 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OatP29758 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OatP29758 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OatP29758 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OatP29758 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OatP29758 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OatP29758 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OatP29758 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OatP29758 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OatP29758 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OatP29758 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OatP29758 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OatP29758 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OatP29758 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OatP29758 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OatP29758 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
OatP29758 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OatP29758 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OatP29758 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OatP29758 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OatP29758 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OatP29758 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OatP29758 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OatP29758 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OatP29758 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OatP29758 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OatP29758 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OatP29758 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OatP29758 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OatP29758 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OatP29758 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OatP29758 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OatP29758 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OatP29758 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OatP29758 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OatP29758 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OatP29758 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OatP29758 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OatP29758 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OatP29758 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OatP29758 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OatP29758 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OatP29758 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OatP29758 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OatP29758 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OatP29758 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OatP29758 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OatP29758 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OatP29758 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OatP29758 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OatP29758 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OatP29758 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OatP29758 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OatP29758 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OatP29758 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OatP29758 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms