Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PtprmP28828 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprmP28828 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprmP28828 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprmP28828 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprmP28828 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtprmP28828 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtprmP28828 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtprmP28828 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprmP28828 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprmP28828 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtprmP28828 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtprmP28828 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprmP28828 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtprmP28828 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
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