Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RxraP28700 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RxraP28700 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RxraP28700 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RxraP28700 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RxraP28700 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RxraP28700 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RxraP28700 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RxraP28700 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RxraP28700 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RxraP28700 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RxraP28700 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RxraP28700 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RxraP28700 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RxraP28700 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RxraP28700 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RxraP28700 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RxraP28700 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RxraP28700 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RxraP28700 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RxraP28700 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RxraP28700 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RxraP28700 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RxraP28700 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RxraP28700 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RxraP28700 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RxraP28700 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RxraP28700 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RxraP28700 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RxraP28700 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RxraP28700 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RxraP28700 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RxraP28700 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RxraP28700 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RxraP28700 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RxraP28700 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RxraP28700 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RxraP28700 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RxraP28700 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RxraP28700 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RxraP28700 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RxraP28700 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RxraP28700 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RxraP28700 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RxraP28700 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RxraP28700 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RxraP28700 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RxraP28700 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RxraP28700 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RxraP28700 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RxraP28700 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RxraP28700 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RxraP28700 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RxraP28700 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RxraP28700 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RxraP28700 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RxraP28700 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RxraP28700 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RxraP28700 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RxraP28700 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RxraP28700 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RxraP28700 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RxraP28700 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RxraP28700 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RxraP28700 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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